最优节制节点算法为疾病连系治疗提供新候选靶标

网络 林晓舟 2019-07-07 13:36  阅读量:12114   

 
西电学子研发  
最优节制节点算法为疾病连系治疗提供新候选靶标  
 

最优控制节点算法为疾病连络治疗提供新候选靶标

如何不范围于已有药物来开拓新颖的连系治疗方案?对付人类常见巨大疾病,好比癌症,第一步治疗往往是手术切除实体肿瘤。然而,癌细胞很难被彻底排除。为了防备癌症复发,化疗、靶向治疗、免疫治疗及这些疗法的连系凡是作为后续治疗方案。连系治疗通过对多种致病通路发挥浸染,是反抗药物抗性和疾病异质性的有效计策。今朝大大都连系治疗的开拓偏重于确定现有药物的协同组合。然而,现有药物仅靶向卵白质组的很小一部门。停止2016年,仅有667种人类卵白质作为FDA核准药物的靶标,而人类共有高出2.1万个卵白质编码基因。因此,大量基因及其组合仍未作为潜在的连系治疗靶标举办摸索。

西安电子科技大学计较机科学与技能学院高琳传授的博士生胡宇轩以第一作者,高琳传授和宾夕法尼亚大学Tan Kai传授为配合通信作者在新近出书的《自然·通讯》上颁发研究论文,提出了疾病连系治疗规模中一个崭新的问题。

该论文通过利用基因表达作为网络可控性框架中的约束,开拓了最优节制节点(OptiCon)算法,这是一个基于网络可控性理论,从基因网络中识别协同调控因子的创新性算法。该算法不需利用药物等先验信息,通过对网络模子上的组合优化问题求解,为疾病连系治疗提供新颖的候选靶标组合。该文章的研究者不只通过计较层面临OptiCon预测功效举办评估,并利用CRISPR/Cas9基因编辑技能对功效精确性举办验证。

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