应对新型冠状病毒 病原组数据库打响“马前炮”

 
 
应对新型冠状病毒 病原组数据库打响“马前炮”  
第673次香山科学集会会议聚焦“病原组国度大数据与生物安详”  

迩来，我国部门医疗机构连续呈现不明原因肺炎病人，后认定为由新型冠状病毒传染引起。此次事件激发科技界思考。

“今朝，我们应对熏染病的计策根基上是被动的。在熏染病疫情产生之后，疏散判断可疑微生物，确定病原体，尔后展开熏染源、动物宿主、流传途径、诊断治疗等研究。这样一来，熏染病必定跑在治疗防范的前面，这是‘马后炮’。”在1月17日举行的香山科学集会会议第673次，“病原组国度大数据与生物安详”接头会上，中国工程院院士、中国疾病防范节制中心徐开国这样说。

新型冠状病毒，真的是“前无昔人”？

此次在武汉发明的新型冠状病毒，据央视新闻报道，中国疾控中心副主任冯子建暗示，通过各类百般观测，相关证据大多指向华南海鲜批发市场。该市场已于1月1日休市。

其基因组测序事情在1月10日已经完成，序列已在网上果真。遗憾的是，今朝已有的基因组数据库中，没有与之相似、临近的数据案例。

为了把“马后炮”酿成“马前炮”，徐开国提出“反向病原学”。

即首先发明、疏散、定名新的微生物，评估其潜在致病性，提出将来大概引起突发熏染病疫情的微生物目次，在此基本上研究检测、诊断、治疗、防控的法子，从而防范产生或早期毁灭疫情。

“已往的教科书说，大部门微生物在19世纪被发明白。错！人类今朝疏散出的病毒和细菌，还不到其全部种类的1%。”徐开国说，西班牙科学家预计世界上存在1012种原核生物，个中主要是细菌。而学术界正式定名的细菌只有15000种阁下，约是其总量的一亿分之一。

“有那么多的细菌、病毒等微生物是未知的，我们不知道哪些致病哪些不致病，怎么能从病原体中发明呢？”会上，他问道。

因此，参会的专家们号令，成立病原组国度数据库。将样本的疏散部位、发明所在、种类等数据信息及基因组数据等全都录入库中，以便在呈现新疫情时，快速溯源、判断。

“冠状病毒在蝙蝠体内最多，各人揣摩是由蝙蝠熏染的，可蝙蝠与人类勾当相隔较远，很有大概存在中间宿主，也许就是某个野活跃物，在海鲜市场里卖的。一提野活跃物，各人都不敢说了，这就没有线索，研究起来更不容易。”北京化工大学生命科学与技能学院院长童贻刚汇报《中国科学报》。

野活跃物携带太多未知病原

童贻刚先容，跟着人类勾当范畴不绝扩大，挤占了野活跃物的原始保包涵况，它们不得不到人类勾当麋集的处所。同时，人们的消费本领提高，越来越多的人去消费各类野味，饲养宠物的人也越来越多。这就导致各人跟野活跃物、前言动物打仗的时机不绝增多。

“对野活跃物来说，有些细菌是它的正常菌群。拿我们最近研究的青藏高本来说，每只秃鹫体内都有大量产气荚膜梭菌，因为它吃死尸，需要借助雷同的细菌辅佐消化，但对人类而言，产气荚膜梭菌成了烈性病原体。”徐开国说，“我们对旱獭的粪便举办研究，发明所有的大肠杆菌菌株中都携带多种致病基因，所有有致病的大肠杆菌的老祖宗，在旱獭身上都能找到。”

他先容，像秃鹫、旱獭等野活跃物，每种可以携带约400-800种细菌，个中至少有40-50种细菌已知是人类的致病菌。青藏高原上有318种野活跃物，它们来到世界上比人类早得多，不行能是有意与工钱敌的。而对付它们携带的微生物，我们知之甚少。

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其实每一种野活跃物身上都携带本身的病毒，这些病毒在一般环境下是不会传染其他物种的。“可是由于病毒的多样性极其巨大，并且病毒老是处在一连的变异进程中，一些特定的基因突变会导致动物病毒跨种流传。一旦动物病毒打破物种屏障，就大概发生新的疫情。”童贻刚说。

建树病原组国度数据库，难在那边？

今朝，我国的病原组数据库都是以病原种类或研究单元为基本成立的，较量零星，没有国度层面统一的数据库。

朱宝利先容，建树病原组国度数据库，整体思路分为三个层面。首先是病原体的疏散造就和生存，在此基本上，对病原体的致病性、耐药性等表型举办判断，并对其基因组举办测定。最后，要将病原体的基因型与表型对应阐明，到达通过基因组序列确认病原体致病性、耐药性、来历的目标，从而实现熏染病的早期预警和防范，为国度生物安详提供全面的保障。

与会专家认为，2003年曾经产生过SARS，假如事先数据库中已经有许多与SARS临近的其他病毒，好比它的“兄弟姐妹”，找起病原体来就会很是快。

今朝，建树病原组国度数据库，存在两浩劫点。

首先是样本和数据尺度化的问题。“病毒、细菌平疏散出来后，其疏散部位、所在、情况信息等，除了基因序列外，测定呆板的型号、测定量等信息也都要记录下来，这是很巨大的，如何能担保各人录入的数据有效？这是接下来需要思考的。”朱宝利说。

另一难点是样本量的问题。朱宝利举例，“像引起腹泻的沙门氏菌，疏散后有2600多个血清型，我们将所有血清型的基因序列都测定了，也不能代表这种菌。因为纵然是同一个基因型，其基因组信息也纷歧样。”

因此，毕竟需要测定哪些、测几多个才气代表一种微生物，还需要相关规模的专家确定。将来，建树病原组国度数据库，需要农业、情况、临床、包罗海关在内的专家、从业者配合尽力。

 

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